원칙 : 기준시가에 의하여 계산합니다.
   - 토 지 : 개별공시지가
   - 건 물 : 국세청장이 정한 기준시가
   - 공동주택 : 국세청장이 토지와 건물을 일괄 고시한 기준시가
다음의 경우에는 실지거래가액으로 계산합니다.
   - 단기매매차익 목적의 투기거래
      · 부동산을 취득할 수 있는 권리를 양도하는 경우
      · 취득 후 1년 이내에 부동산을 양도하는 경우
   - 조세부담 회피목적의 투기거래
      · 허위계약서작성, 주민등록허위이전 등 부정한 방법으로 부동산을 취득 양도하는 경우
      · 미등기자산을 양도하는 경우
   - 고가주택을 양도하는 경우
   - 실지거래가액으로 양도소득세를 신고하는 경우
     · 양도자가 양도 및 취득 당시의 실지거래가액을 증빙서류와 함께 양도소득세 확정신고
      기한까지 납세지 관할 세무서장에게 신고하는 경우
   - 부동산가격이 급등하였거나 급등할 우려가 있어 재정경제부장관이 지정하는 지역에 소재하는
      부동산
   - 1세대 3주택 이상 소유자가 양도하는 주택( 2002 . 10 . 1이후 양도분부터)

- 토지에 대한 기준시가를 적용함에 있어서 새로운 기준시가가 고시되기 전에 취득 또는 양도한 경우에는 직전의 기준시가에 의합니다.

예) ’99.5.30 취득시 : 취득 기준시가는 ’98.1.1 기준 개별공시지가 적용
     ’03.8.10 양도시 : 양도 기준시가는 ’03.1.1 기준 개별공시지가 적용

기준시가로 신고한 경우
- 토지：취득당시 개별공시지가 × 3% (미등기는 0.3% )
- 건물：취득당시 국세청 기준시가 × 3% (미등기는 0.3% )
실지거래가액으로 신고한 경우
- 소개비, 용도변경·개량비, 자본적지출 및 양도비용 등
※ 취득세·등록세 등 취득에 소요된 비용은 취득가액에 가산합니다.

장기보유 특별공제(토지와 건물만 공제됨)
- 보유기간이 3년 이상 5년 미만 : 양도차익의 10 %
- 보유기간이 5년 이상 10년 미만 : 양도차익의 15 %
(기준면적 미만의 고가주택은 25%, 1세대 1주택 비과세 요건을 갖춘 경우에 한함)
- 보유기간이 10년 이상인 경우 : 양도차익의 30 %
※ 60% 중과대상인 1세대 3주택 이상자의 주택에 대하여는 장기보유특별공제를 적용하지 아니함(2004.1.1 이후 시행)
※ 기준면적 미만 고가주택 : 2003.1.1 이후 양도분부터 적용
- 공동주택(아파트 등) : 전용면적 45평 미만
- 단독주택 : 건평 80평 미만이고 동시에 대지 150평 미만인 것
양도소득 기본공제
주식과 주식 외 자산(부동산, 부동산에 관한 권리, 기타자산)으로 구분하여 각각 연간 250만원을 공제합니다.
- 1년에 2회 이상 양도하는 경우에는 그 과세기간 중 먼저 양도하는 양도소득금액에서부터 순차로 공제합니다.

※ 투기지역에 대하여는 필요시 대통령령(시행령)으로 기본세율의 ±15% 범위 내에서 탄력세율을 적용할 수 있으며, 특히 1세대 2주택 이상에 해당하는 주택의 양도차익에 대하여 우선 적용합니다.
- 이 경우 1세대 2주택 이상의 보유주택수 판정은 60% 중과세율이 적용되는 1세대 3주택 이상의 경우와 같습니다.
※ 60%의 세율이 적용되는 1세대 3주택 이상 판정시 포함되는 주택
- 지역기준 : 다음의 지역을 제외한 수도권, 광역시 소재 주택
· 수도권(서울,인천,경기)광역시중 군지역 및 도농복합시의 읍 면지역
· 수도권중 주택보급률, 주택가격 및 그 동향을 감안하여 재정경제부령으로 정하는 지역
- 가격 기준 : 기타지역에 소재하는 주택(지역기중에서 제외되는 주택 포함)으로서 기준시가 3억원을 초과하는 주택