① 부양가족(배우자, 부모님, 자녀)의 소득금액이 100만원을 초과하는데 소득공제 받는 경우

② 맞벌이 부부의 경우 - 배우자의 소득금액이 100만원(연봉500만원)이 초과하는데 배우자공제를 받거나 - 부부가 각각 자녀, 부모, 형제자매 기본공제나 특별공제를 이중으로 공제 받는 경우

③ 부모님을 형제들이 이중으로 공제 받은 경우

④ 2개 회사이상으로부터 급여를 받거나 퇴사 후 퇴직연도에 재취업 했는데 종전(종된) 근무지소득을 합산하여 연말정산하지 않은 경우 - 12월말 현재(주된)직장에 종전(종된 근무지급여를 신고)근무지 근로소득원천징수영수증을 제출해야 한다.

⑤ 국세청 연말정산간소화 서비스상 주택공제내용은 금융기관에서 제공한 금액을 단순히 보여주기만 하므로, 구체적인 공제요건은 근로자 스스로 해당여부를 확인해야 하는데, 확인하지 않고 공제받는 경우 : 예컨대 2006.1.1.이후 차입금으로 기준시가 3억을 초과하는데 공제 받는 경우는 국세청전산에서 자동으로 적발될 가능성이 높다.

※ 이중공제, 부당공제 받은 경우 국세청 전산에서 자동적발 되어 가산세 포함 추징된다. 부당공제받는 연도의 다음해 5월에 소득세확정신고 안내문을 받게 되고, 자진하여 부당공제 받은 부분을 빼고, 다시 정산하여 소득세확정신고후 세금을 납부해야 하므로 납세자입장에서는 매우 번거롭기 때문에 주의해야 함